Endoskopie je vyšetření, při kterém se vnitřek trávicí trubice zkoumá pomocí přístroje zvaného endoskop.
Endoskop je dlouhá, tenká, ohebná trubice, která má na jednom konci světelný zdroj a kameru. Obrazy uvnitř trávicího traktu jsou předávány na televizní obrazovku. Endoskopy jsou zaváděny přirozenými otvory (tj. ústy při vyšetření horní části trávicí trubice nebo konečníkem při vyšetření dolní části trubice).

Endoskopické vyšetření se obvykle provádí při určitých obtížích nemocného ke stanovení diagnózy nebo jako terapeutický výkon (např. odstranění polypů, stavění krvácení, dilatace stenóz trávicí trubice aj.). Při endoskopii je také možné odstranit malý vzorek tkáně (biopsie) pro další analýzu.